- En trois ans, Generare est devenue la principale plateforme de génération de données moléculaires issues de l’évolution, répondant à un enjeu stratégique pour l’industrie pharmaceutique
- Sa technologie propriétaire a permis de révéler plus de 200 petites molécules inédites, avec un taux de succès comparable aux meilleurs programmes de découverte de médicaments de l’histoire
- En 2025, Generare a caractérisé cinq fois plus de nouvelles molécules que l’ensemble des autres acteurs du secteur
- Le financement, co-dirigé par Alven et daphni, permettra de multiplier par dix le jeu de données moléculaires de Generare d’ici 2027, à mesure que la demande des leaders mondiaux des sciences du vivant s’intensifie.
2 avril 2026 : Generare, l’entreprise de techbio qui décode le vivant pour générer des données moléculaires inédites et de haute qualité destinées au développement de nouveaux médicaments, annonce une levée de fonds de 20 M€ en Série A. Co-dirigée par Alven et Daphni, la levée intègre une participation de l’ensemble de ses investisseurs existants, dont Galion.exe, Teampact Ventures et VIVES Partners. Ce financement sera consacré à l’élargissement de la chimiothèque de Generare, au renforcement de son équipe de renommée internationale ainsi qu’à la montée en puissance de sa plateforme de découverte, dans le but de répondre à la demande croissante des géants pharmaceutiques et agrochimiques.
Décoder le vivant
Fondée en 2023 par Guillaume Vandenesch (CEO) et le Dr Vincent Libis (CSO), Generare développe un dataset de chimie moléculaire unique au monde : une bibliothèque de composés inédits et de très haute qualité, jamais identifiés et rigoureusement caractérisés selon leur structure, leur activité biologique et leur potentiel thérapeutique.
Depuis des décennies, la découverte de médicaments est circonscrite à un périmètre chimique étroit : on estime à 3% la diversité moléculaire connue à ce jour. Or le génome microbien abrite un réservoir de chimie moléculaire que l’évolution a mis trois milliards d’années à écrire, dont 97% reste à lire. Generare génère ces nouvelles données moléculaires à un niveau de qualité inédite et à l’échelle, les rendant directement exploitables pour le développement de nouveaux médicaments.
La technologie propriétaire de clonage et de séquençage à haut débit de Generare, validée par des travaux de recherche académique financés par l’ERC et de multiples publications évaluées par des pairs, décode cette chimie cryptique à l’échelle industrielle. Elle examine des dizaines de milliers de génomes microbiens, identifie les séquences génétiques les plus susceptibles de produire des molécules bioactives, les exprime, puis caractérise les composés obtenus : structure, activité biologique et potentiel médicamenteux.
Generare se spécialise dans les petites molécules, la classe de composés qui a historiquement eu le plus d’impact sur l’espérance de vie humaine, et révolutionné la médecine au XXe siècle. Chaque nouvelle petite molécule découverte constitue une nouvelle donnée, alimentant un dataset qui s’enrichit à chaque cycle.
Guillaume Vandenesch, CEO et co-fondateur de Generare, déclare : « La découverte de nouveaux médicaments est aujourd’hui un sujet de data. L’ensemble du secteur entraîne ses modèles sur la même chimie recyclée et converge inévitablement vers les mêmes impasses. Pour nous, l’enjeu est de fournir aux laboratoires et à leurs algorithmes des données moléculaires nouvelles, inédites et de haute qualité. Nous construisons un dataset unique au monde de petites molécules cryptiques. Ces molécules, façonnées par 3 milliards d’années d’évolution et dotées de propriétés médicamenteuses qu’aucune chimiothèque synthétique ne peut égaler, alimentent le prochain siècle de découverte de médicaments.»
Des données moléculaires sur lesquelles aucun modèle d’IA n’a jamais été entraîné
Le cercle vertueux inhérent à l’approche de Generare confère à son dataset une valeur stratégique pour ses partenaires, parmi lesquels figurent certaines des principales entreprises pharmaceutiques mondiales. Ce caractère stratégique se renforce à mesure que l’IA transforme la découverte de médicaments. En effet, si l’IA peut accélérer la recherche de nouveaux traitements, elle ne peut pas créer de nouvelle chimie pour s’entraîner.
En effet, sans donnée inédite, les modèles continueront de converger vers les mêmes résultats, quel que soit leur degré de sophistication. Alimentez-les en structures véritablement nouvelles, sélectionnées par l’évolution, avec l’activité biologique correspondante, et l’impact se démultiplie.
Une traction de premier plan
En seulement trois ans, Generare est devenue la principale plateforme de génération de données moléculaires issues de l’évolution. En 2025, l’ensemble des acteurs du secteur n’a découvert que quelques dizaines de nouvelles molécules quand Generare, à elle seule, en a révélé plus de 200. Ces molécules sont désormais utilisées par des laboratoires de recherche pour développer de nouveaux traitements contre des maladies potentiellement mortelles.
Le financement de 20 M€ permettra à Generare de décupler cette capacité d’ici 2027 pour atteindre plus de 2 000 molécules, avec l’ambition de dépasser les 10 000 à terme, atteignant en quelques années ce qui prenait jusque-là des décennies. Il permettra également de doubler l’équipe de 25 personnes composée de bio-informaticiens, chimistes, biologistes de synthèse, techniciens et ingénieurs, venus de France, du Royaume-Uni, des États-Unis, d’Allemagne, d’Australie et d’ailleurs. Parmi les conseillers de l’entreprise figurent le Dr Frank Petersen, ancien directeur exécutif du département de chimie des Produits Naturels de Novartis et la professeure Nadine Ziemert, l’une des principales expertes européennes des clusters de gènes biosynthétiques microbiens.
Dr Vincent Libis, CSO et co-fondateur de Generare, déclare : « La nature est la source n°1 de modes d’action innovants pour les médicaments, et nous n’avons fait qu’effleurer son potentiel. Nous construisons l’infrastructure pour changer la donne, avec la plus grande bibliothèque commerciale de données moléculaires issues de l’évolution au monde, un jeu de données qui s’améliore à chaque cycle, et une plateforme capable de fournir aux entreprises des points de départ véritablement nouveaux pour la découverte de médicaments.»
Maria Tahri, Bio Investor chez Alven, déclare : « Tandis que la techbio accélère la découverte de médicaments, Generare va plus loin en rouvrant la pharmacie de la nature à l’échelle industrielle. En combinant génomique, biologie de synthèse et apprentissage automatique, l’entreprise génère des jeux de données propriétaires sur des mécanismes d’action inconnus, déverrouillant des opportunités thérapeutiques que d’autres ne savent pas voir et construisant un avantage concurrentiel qui suscite déjà un fort intérêt de l’industrie.»
Paul Bazin, Partner chez daphni, déclare : « Depuis la découverte de la pénicilline jusqu’à nos jours, la pharmacie moderne est née de produits naturels. Pourtant, depuis des décennies, l’industrie est bridée par son incapacité à accéder à de nouvelles molécules issues de l’évolution. En déverrouillant les 97 % restants de produits naturels encodés dans les génomes microbiens, Generare lève ce verrou fondamental et n’élargit pas simplement l’espace chimique : ils le redéfinissent. Cela marque un tournant profond pour l’industrie : le défi n’est plus de concevoir de nouvelles molécules, mais de comprendre comment traduire au mieux ce réservoir biologique en avancées majeures pour la santé et l’agriculture. »
FIN
Notes à l’attention des rédactions
Dr Frank Petersen, Président du Comité Scientifique Consultatif de Generare, déclare : « La rapidité avec laquelle cette plateforme convertit des séquences génomiques brutes en données de haute qualité exploitables par l’IA, combinée à la rigueur de l’équipe et à l’intégration de son expertise à chaque étape, est sans équivalent à ce stade de développement. Ce que Generare construit façonnera la découverte de substances bioactives d’origine naturelle pour les secteurs pharmaceutique, agro-industriel et cosmétique pour longtemps.»
*Le CEO, Guillaume Vandenesch, ingénieur biotech diplômé d’AgroParisTech, a contribué à la montée en puissance de Hello Tomorrow, une organisation mondiale à but non lucratif qui soutient et accélère le développement des startups deep tech. En tant que directeur, il a conduit le studio d’innovation Possible Future jusqu’à son acquisition par Capgemini en 2022.
*Le CSO, Vincent Libis, PharmD, PhD, développe depuis 10 ans des approches de biologie de synthèse pour la manipulation de clusters de gènes biosynthétiques dans le contexte de la découverte de médicaments. Auparavant co-fondateur d’Abolis Biotechnologies et chercheur postdoctoral à l’Université Rockefeller, ses travaux en tant que chef d’équipe
INSERM ont été récompensés par une prestigieuse Starting Grant du Conseil Européen de la Recherche (ERC) et constituent le fondement scientifique de la plateforme de Generare.
À propos de Generare
Generare est une techbio parisienne fondée en 2023 par le Dr Vincent Libis et Guillaume Vandenesch. Sa plateforme propriétaire décode ce que le vivant a écrit : elle décode les génomes microbiens, exprime leur chimie silencieuse et génère à l’échelle les données moléculaires inédites et de haute qualité pour favoriser le développement de médicaments. En savoir plus sur Generare.bio
À propos d’Alven
Fondé en 2000, Alven est un fonds de capital-risque indépendant dédié au early stage qui accompagne les entrepreneurs européens dans la construction d’entreprises de référence à l’ambition mondiale. Avec plus de 1,5 Md€ d’actifs sous gestion, Alven a investi dans plus de 160 startups au cours des deux dernières décennies, dont Qonto, Dataiku, Algolia, Stripe et Cardiologs. Positionné sur le Seed et la Série A, le fonds investit dans l’IA, la santé, la fintech et les plateformes grand public. Avec son sixième fonds de 350 M€, Alven continue d’accompagner les fondateurs early stage jusqu’au growth, en s’appuyant sur une approche hands-on et une expertise opérationnelle approfondie. www.alven.co
À propos de daphni
Fondé en 2015, daphni est un fonds de capital-risque à mission et certifié B Corp, qui investit dans les technologies de rupture et les projets durables. Il compte plus de 70 entreprises en portefeuille, dont Back Market, Pasqal, Carbon Maps, Hubcycle, Swile, Moonwatt et Geev. Soutenu par une communauté de 400 experts, daphni s’appuie sur sa plateforme propriétaire Flamel. Il gère également Dastore, un fonds de tech retail en partenariat avec Carrefour, et a lancé en mars 2026 Time4, un fonds dédié à l’accompagnement d’entrepreneurs issus de la diversité. En parallèle, son fonds de dotation Rainbow soutient des initiatives d’inclusion sociale. www.daphni.com